世界衛生組織(WHO)於本年 4 月建議使用 COVID-19 JN.1 疫苗(以下簡稱 JN.1 疫苗)，作為 2024-2025 COVID-19 疫苗抗原成分，以提升對抗主流病毒株之免疫保護力，且為因應病毒演變，依據本年 7 月 9 日衛福部傳染病防治諮詢會預防接種組(ACIP)決議，採用 JN.1 疫苗防範秋冬疫情。
依據 WHO 、美國 CDC 及相關研究報告顯示，同時接種流感疫苗與 COVID-19 疫苗是安全的，且可提升疫苗接種率、減少就診次數及接種便利性，降低併發 COVID-19 及流感重症發生風險，爰衛福部自本年 10 月 1 日起提供 JN.1 疫苗與流感疫苗可同時(分開不同部位)接種，實施期程及開放接種對象如下：
１、第一階段(本年 10 月 1 日起)：同流感疫苗第一階段實施對象。〔流感疫苗公費對象（參考網址： https://gov.tw/uAF )〕
２、第二階段(本年 11 月 1 日起)：出生滿 6 個月以上民眾(未列在第一階段實施對象)。
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